C'est dans la chapelle des Annonciades et son annexe que sont présentées la majeure partie des expositions temporaires (y compris celles du Musée) qui sont, pour la plupart et souvent depuis de nombreuses années, des rendez-vous annuels.
Le record de longévité est sans doute détenu par le Salon des Annonciades qui occupe ces locaux chaque été depuis 1924 pour présenter des oeuvres d'artistes professionnels comtois et suisses.

Consultez la rubrique "Expositions" de la plaquette Rendez-Vous animations pour connaître les expositions du mois.